Cuzcatlán, era desde la antigüedad la ciudad célebre por sus riquezas y el poderío de sus príncipes, la misma fue considerada la principal metrópoli de los aborígenes pipiles de El Salvador Precolombino. Fundada en 1504 por el monarca Topiltzín Acxitl y librada de muchas guerras por el valiente nativo Atlacatl, quien reinó en el lugar antes de la época colonial.
En 1770, su población apenas la formaban 19 familias indígenas y 115 ladinos. Los siglos han transcurrido y sucesos importantes han marcado la historia de la ciudad. Cuscatlán constó con los distritos o partidos de Cojutepeque y Suchitoto, creados respectivamente en 1786. El departamento fue constituido durante la administración del jefe de Estado Nicolás Espinoza, por Decreto Ejecutivo el 22 de mayo de 1835.